Το Μουσείο της Εκπαίδευσης του Πανεπιστημίου Κρήτης που τελεί υπό την αιγίδα της Περιφέρειας Κρήτης ιδρύθηκε με σκοπό: την αναζήτηση, καταγραφή, διαφύλαξη, έκθεση και επιστημονική μελέτη του εκπαιδευτικού σχολικού παρελθόντος και της ιστορίας του διδασκαλικού επαγγέλματος κατά την νεότερη περίοδο της ελληνικής ιστορίας, την συμβατική και ψηφιακή του ανάδειξη και προβολή, τη διασύνδεσή του με την ελληνική εκπαιδευτική και σχολική πραγματικότητα και την προώθησή του ως προστιθέμενη ευρωπαϊκή πολιτισμική αξία και σημαντική ιστορική παράμετρο για το σχολείο του 21ου αιώνα.
Περιλαμβάνει ιστορικό υλικό και σπάνια τεκμήρια της Παιδαγωγικής Ακαδημίας Ηρακλείου καθώς επίσης και σημαντικά εκθέματα των ελληνικών σχολείων από τα τέλη του 18ου αιώνα μέχρι και τα τέλη του 20ου.
Τα πολιτιστικά εκπαιδευτικά προγράμματα που σχεδιάζονται και υλοποιούνται στις συλλογές του έχουν ως στόχο, μέσω της επαφής με τα πλούσια εκπαιδευτικά τεκμήρια και κειμήλια, να ενισχύσουν τους πολιτιστικούς δεσμούς των μαθητών/τριών, φοιτητών/τριών, των εκπαιδευτικών αλλά και ευρύτερου κοινού με την εκπαιδευτική πολιτιστική ιστορία του τόπου και με το εγγύτερο ιστορικό εκπαιδευτικό παρελθόν.
Με την αξιοποίηση του εκθεσιακού υλικού αλλά και με τη χρήση των εργαλείων που παρέχουν οι νέες τεχνολογίες, οι επισκέπτες/ τριες εμπλέκονται βιωματικά σε ψυχοσωματικές και κιναισθητικές δραστηριότητες, προκειμένου να αναστοχαστούν δημιουργικά το παρόν τους και να οικοδομήσουν μια πανανθρώπινη πολιτισμική συνείδηση. Με αυτό τον τρόπο γίνονται «ενεργοί», ενισχύεται η μουσειακή μάθηση και εμπειρία τους και ωθούνται σε μια διαφορετική και καινοτόμο «ανάγνωση» και «ερμηνεία» του μουσειακού πολιτισμού μας.